Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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