Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rhbdd2Q8VEK2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rhbdd2Q8VEK2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms