Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms