Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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