Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms