Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc174Q3U155 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms