Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms