Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms