Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms