Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms