Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms