Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms