Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms