Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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