Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNMO15061 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms