Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm21887J3QQ04 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps147-201ENSMUST00000177028 513 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Stn1-207ENSMUST00000182808 1618 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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