Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn5F6UCX4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms