Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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BC067074F6RXI4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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BC067074F6RXI4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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BC067074F6RXI4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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BC067074F6RXI4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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BC067074F6RXI4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BC067074F6RXI4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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