Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm17727E9Q4V7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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