Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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