Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Kcnip3Q9QXT8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Kcnip3Q9QXT8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Kcnip3Q9QXT8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms