Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms