Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rassf1Q99MK9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rassf1Q99MK9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms