Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PtprtQ99M80 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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