Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms