Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rhbdd2Q8VEK2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms