Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul7Q8VE73 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul7Q8VE73 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms