Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hpf1Q8CFE2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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