Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms