Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lama3Q61789 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lama3Q61789 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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