Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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