Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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