Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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