Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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