Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rbp2Q08652 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms