Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Kcnma1Q08460 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Kcnma1Q08460 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kcnma1Q08460 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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