Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms