Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx1P70314 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms