Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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