Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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