Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RhoP15409 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhoP15409 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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