Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms