Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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