Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnd2O35927 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms