Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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