Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3424L7N298 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms