Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arfgef1G3X9K3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms