Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms