Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms