Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms